IE版のスキンは、スタイルシートやJavaScriptを使って様々な機能を追加したり、見た目を華やかにしたりと非常に自由度の高いカスタマイズが可能です。 多くのユーザーによってスキンが作成されています。
「スキン標準化プロジェクト」によって、どの２ちゃんねる専用ブラウザでも使用可能な「標準スキン」の仕様が決まりました。 Jane StyleのIE版では、「標準スキン」の仕様に沿ったスキンをそのまま使用できます。 下記サイトで様々なスキンが配布されています。自分の利用に合った便利なスキンを探してみるといいかもしれません。